samedi 27 mars 2010

Un nouveau type d'hominidé découvert en Sibérie par l'équipe de Svante Pääbo

L’analyse d’un fragment d’os provenant d’une phalange humaine trouvée dans une grotte de Denisova en Sibérie révèlerait l’existence d’un troisième type d’hominidé.

Celui-ci aurait vécu il y a 40.000 ans en Sibérie, à la même période que l’homme de Néanderthal et que l’homme moderne Homo sapiens sapiens, nous apprend un article du magazine Nature publié le 25 mars 2010.

En été 2008, des chercheurs russes déterraient un fragment d'os provenant de la phalange d’un auriculaire humain dans une caverne située à Denisova, dans les monts Altaï en Sibérie.

L’équipe n’y avait pas prêté d’attention particulière et l’avait laissé de côté pour effectuer de futures recherches. Les chercheurs pensaient que ce fragment provenait d’un homme de Néanderthal et ne s’attendaient pas à cette découverte.

Seulement, lors des analyses, l’ADN provenant des mitochondries du fragment d’os ne correspondait pas à celui de l’homme de Néanderthal ni à celui des hommes modernes qui vivaient aussi à proximité à cette époque.

Les données génétiques publiées en ligne sur le site du magazine Nature révèlent que l’os pourrait appartenir à une espèce humaine jusqu’alors inconnue. Elle aurait migré de l’Afrique bien avant les ancêtres connus et se serait ensuite éteinte.

Références

- Un nouveau genre d’hominidé découvert ?, Maxisciences, 25 mars 2010

- The complete mitochondrial DNA genome of an unknown hominin from southern Siberia. Krause J, Fu Q, Good JM, Viola B, Shunkov MV, Derevianko AP, Pääbo S. Nature. 2010 Mar 24. PMID: 20336068

With the exception of Neanderthals, from which DNA sequences of numerous individuals have now been determined, the number and genetic relationships of other hominin lineages are largely unknown. Here we report a complete mitochondrial (mt) DNA sequence retrieved from a bone excavated in 2008 in Denisova Cave in the Altai Mountains in southern Siberia. It represents a hitherto unknown type of hominin mtDNA that shares a common ancestor with anatomically modern human and Neanderthal mtDNAs about 1.0 million years ago. This indicates that it derives from a hominin migration out of Africa distinct from that of the ancestors of Neanderthals and of modern humans. The stratigraphy of the cave where the bone was found suggests that the Denisova hominin lived close in time and space with Neanderthals as well as with modern humans.

- A complete mtDNA genome of an early modern human from Kostenki, Russia. Krause J, Briggs AW, Kircher M, Maricic T, Zwyns N, Derevianko A, Pääbo S. Curr Biol. 2010 Feb 9;20(3):231-6. PMID: 20045327

The recovery of DNA sequences from early modern humans (EMHs) could shed light on their interactions with archaic groups such as Neandertals and their relationships to current human populations. However, such experiments are highly problematic because present-day human DNA frequently contaminates bones. For example, in a recent study of mitochondrial (mt) DNA from Neolithic European skeletons, sequence variants were only taken as authentic if they were absent or rare in the present population, whereas others had to be discounted as possible contamination. This limits analysis to EMH individuals carrying rare sequences and thus yields a biased view of the ancient gene pool. Other approaches of identifying contaminating DNA, such as genotyping all individuals who have come into contact with a sample, restrict analyses to specimens where this is possible and do not exclude all possible sources of contamination. By studying mtDNA in Neandertal remains, where contamination and endogenous DNA can be distinguished by sequence, we show that fragmentation patterns and nucleotide misincorporations can be used to gauge authenticity of ancient DNA sequences. We use these features to determine a complete mtDNA sequence from a approximately 30,000-year-old EMH from the Kostenki 14 site in Russia.

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